玉米的種子主要由種皮、胚乳和胚3部分組成。

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種皮：果皮與種皮緊密相連不易區分，習慣上均稱之為種皮。種皮主要有纖維素構成，表面光滑，一般無色，包圍整個種子，約占種子總重量的6%-8%。具有保護種子不受外力機械損傷和防止病蟲害入侵的作用。

胚乳：玉米的胚乳位于種皮內部，最外層由單層細胞組成，這些細胞充滿含有大量蛋白質的糊粉粒，組成糊粉層。糊粉層下不的胚乳分為粉質胚乳、角質胚乳（二者是由蛋白質所占比例不同來區分的）。胚乳占種子總重量的80%-85%。起到貯藏養料，供給種子萌發的作用。